Takımın tek sağ bek'i olan Glen Johnson'a rakip geldi. Glen'i antrenmanlarda zorlayacak ve rekabeti arttıracak bu isim Gökhan Gönül. Hızı,Gücü ve Fiziğiyle Premier Lig'e kolay uyum sağlayacağını düşündüğüm Gökhan'ı Fenerbahçeden 48 ay taksitle 8.500.000 € karşılığında transfer ettik.


Savunmanın sağında görev yapmaktadır.2006 yılında Gençlerbirliği Oftaş'ta oynarken Galatasaray, Gönül'ü 19 yaşındayken istemiş, fakat İlhan Cavcav'ın Gökhan için 2.5 milyon Euro gibi çok fazla bir miktar istemesi transferi gerçekleştirmemiştir ve Gökhan bir sene daha Gençlerbirliği Oftaş'da forma giymiştir.2007 yılında Fenerbahçe'ye 6 yıl için 3 milyon euro'ya transfer olmuştur. Türkiye'nin en iyi sağ bekidir ve dünyanın sayılı sağ beklerinden biridir. 2010 yılında FIFA'nın açıkladığı listede Maicon, Dani Alves, Sergio Ramos, Bacary Sagna gibi dünyaca ünlü isimlerin bulunduğu dev listede kendisine onbirinci sıradan yer bulmuştur.

Milli formayla ilk maçına 17 Kasım 2007'de Norveç'e karşı çıkmış ve ilk maçında bir de asist yapmıştır. Maç sonrasında duygularını "Sadece ufak bir heyecanım vardı. Onu da topla ilk buluşmamda üzerimden attım. Kendime güvenim vardı." diyerek ifade etmiştir.

Gönül'ün Euro 2008 öncesi sakatlanıp turnuvayı kaçırması ise kendisi ve hem de Türkiye için büyük bir şanssızlık oldu. Gökhan, 2007-2008 sezonu sonlarında Fenerbahçe'nin oynadığı maçlarda sahaya sakat olarak çıktığı için ağrıları nüksetmiş ve tedavisi Euro 2008'e yetişemeyerek Milli Takım kadrosundan çıkarılmıştır.